"Neftçi" kulübünün kuruluşundan bu yana 89 yıl geçti. Azerbaycan'ın en köklü kulübü 1937'de kuruldu ve 1968'e kadar "Neftyanik" olarak adlandırıldı. Renkleri "siyah beyaz" olan takımın "Flagman", "Halk Takımı" ve "Petrolcüler" gibi lakapları vardır.
Sport24.az'ın haberine göre, "Neftçi" kurulduğu 1937'de SSCB şampiyonasında mücadele etti. İlk olarak 1949'da SSCB Şampiyonası'nın En Güçlüler Ligi'nde yer alma hakkı kazanan "Flagman", 1950, 1960-1972, 1977-1988 yıllarında da bu ligde mücadele etti. Takım bu dönemdeki en büyük başarısını 1966'da 3. olarak bronz madalya kazanarak elde etti. "Siyah beyazlılar" 1967, 1968, 1970, 1971'de SSCB Kupası'nda yarı finalist, 1988'de ise SSCB Futbol Federasyonu Kupası'nda finalist oldu.
Ülkedeki en büyük taraftar kitlesine sahip olan "Neftçi", 9 kez – 1992, 1996, 1997, 2004, 2005, 2011, 2012, 2013 ve 2021'de Azerbaycan şampiyonası altın madalyalarına sahip oldu. "Halk Takımı" 6 kez ülke kupasını (1995, 1996, 1999, 2004, 2013, 2014) ve 2 kez de süper kupayı (1993, 1995) kazandı. 2006'da ise "Birlik Kupası"nı başının üzerine kaldırdı. "Neftçi" 2012/13 sezonunda UEFA Avrupa Ligi'nde grup aşamasına katılmaya hak kazanarak Azerbaycan futbol tarihinde bir ilke imza attı.